EA999發動機和EA888發動機在可靠性和耐久性方面存在一定差異，EA888發動機經過多年市場檢驗，可靠性較高，耐久性也有不錯的表現。EA888發動機采用了直噴、渦輪增壓、可變氣門正時等技術，讓其燃燒更徹底、動力輸出強勁且駕駛舒適性佳。同時，它具備優良散熱性能，高效冷卻系統可有效控制溫度，高強度材料和先進工藝保證了發動機壽命 ，這些都為其可靠性和耐久性奠定基礎。

第三代EA888發動機在可靠性上進一步提升，故障率相對較低。它采用先進技術和材料，渦輪增壓技術讓車輛在低轉速時就能擁有高扭矩，加速性能良好，最大功率和扭矩都有所提升，動力更為充沛。在燃油經濟性方面，通過優化燃燒過程、降低內部摩擦等措施，有效降低了油耗。而且在排放方面，配備顆粒捕集器等環保技術，污染物排放表現優秀。此外，大眾汽車集團還為這款發動機提供長達10年的質保服務，這也從側面反映出對其可靠性的信心。

而EA999發動機雖然同樣具備優秀的性能，但在一些細節方面與EA888有所不同。在可靠性上，由于技術應用和設計的差異，它在特定工況下可能會面臨一些小問題。比如部分車型可能會出現相對復雜的電子系統故障，但這并不影響整體的可靠性表現。在耐久性方面，相較于EA888發動機成熟的散熱和材料工藝，EA999發動機在長時間高負荷運轉時，可能對發動機內部部件的損耗相對較大一些。不過這也不是絕對的，日常合理使用和保養得當，EA999發動機也能擁有出色的耐久性。

綜上所述，EA888發動機和EA999發動機在可靠性和耐久性方面各有特點。EA888發動機憑借多年市場沉淀和成熟技術，在這兩方面表現穩定且優秀；EA999發動機雖然存在一些差異，但也具備良好的性能與品質，消費者可根據實際需求和使用場景來選擇搭載不同發動機的車型。