摩托車水冷和風冷的區別有：散熱方式不同、配置不同、成本不同、占用空間不同、大小不同、特點不同。

散熱方式不同：風冷發動機是利用摩托車行駛時空氣的流通來散發熱量的，這種散熱方式不能讓車輛長期處在高強度的運行狀態，而水冷的散熱方式是通過流動的水包裹缸套和缸頭來降溫。

配置不同：風冷的缸筒會設計很大的散熱片，缸頭會設計散熱片以及風道，而水冷的基本配件是水泵，水箱溫控還有風扇。

成本不同：風冷發動機的成本要比水冷發動機的成本更低，售價也更低。

占用空間不同：風冷發動機構造簡單，所占用的空間也更小，而水冷發動機的構造復雜，所占用的空間也更大。

大小不同：風冷發動機結構簡單，體積小，隱藏性比較好，而水冷發動機的體積往往比較大，從摩托車的側面和前面很容易看到。

特點不同：風冷的特點是散熱系統零故障自然冷卻，水冷的特點是對高功率高轉速的發動機進行有效地溫度控制，水冷車在溫度低的時候節流閥會關閉，直到機油溫度升高以達到潤滑效果。