柴油發動機的排放標準是有明確規定的。

目前常見的有國六標準，這是世界上最嚴格的機動車排放標準之一。國六標準相比國五，增加了氮氧化物和顆粒物的限值，冷啟動工況下要降低一氧化碳含量 50%，碳氫化合物含量 30%，一氧化碳含量 30%。

達到國三排放標準，最難的是降低顆粒和氮氧化物的排放，降低顆粒的途徑主要有提高燃油系統的噴射壓力和降低發動機機油消耗，對于氮氧化物，有效的辦法是減少燃燒過程中的氧含量和降低燃燒溫度。

國四是在國三基礎上增加了車載診斷系統、排放控制裝置的耐久性要求、微粒捕集器、采用更高一代的共軌壓力等。

對于 3.5T 以上的車型，國三排放標準要求 CO 排放不得超過 2.1g/(kWh)，HC 排放不得超過 0.66g/(kWh)，NOX 排放不得超過 5.0g/(kWh)，PM 排放不得超過 0.13g/(kWh)，煙度不得超過 0.8（1/m）。

為達到這些標準，柴油發動機需配備先進的排放控制技術和設備，像顆粒捕集器、催化轉化器等。

柴油車尾氣排放標準中，一氧化碳不得超過 2.2g/km，碳氫化合物不得超過 1.13 克/公里，柴油車顆粒物標準不得超過 0.18 克/公里，耐久性要求是 50000km。