單位車輛在福州的交巡警違章查詢流程主要有以下幾種方式：

方式一：登錄當地交警隊網站，輸入車牌號、發動機號進行查詢。

方式二：在手機上下載交通管理 12123APP，事先備案公司車輛，輕松實現在線查詢。備案步驟為：進入【違法處理】界面，在首頁功能區點擊【違法處理】圖標進入；在頁面底部點擊【備案更多機動車】按鈕進入；選擇車牌的種類，錄入號牌號碼，然后點擊【備案】；備案好公司名下的車輛以后，在車輛信息右側，點擊【查詢】選項，在【未處理】列表中，即可查看到該車輛的違章查詢結果。

方式三：前往交警部門，攜帶身份證、駕駛證以及車輛行駛證進行查詢。

方式四：利用微信公眾號查詢，打開微信，搜索單位車輛所在地的交警公眾號。然后進入公眾號，在公眾號左下角點擊微業務，有個小彈窗，點擊“違法查詢”，輸入車牌和識別代碼之后點擊查詢，就可以查到公司車輛的違章記錄。

方式五：通過支付寶 APP 查詢，打開支付寶 APP 界面，在界面上方搜索欄內輸入違章繳費，然后打開搜索結果里面的違章繳費小程序，接著在新的頁面上輸入公司車輛信息進行綁定以便后續的查詢情況，在添加車輛信息上面輸入車牌號碼，車輛類型，車架號，發動機號等信息，填完之后點擊保存。再回到違章繳費的頁面點擊違章查詢，就可以看到該車輛的違章記錄。

方式六：訪問網站資源，如“車主指南”等，憑借車輛相關信息免費查詢違章情況。

處理違章手續需要攜帶員工的身份證、駕駛證和車輛行駛證外，還需提供公司開具的委托書、營業執照和代碼證復印件。在交警部門辦理違章處罰流程與私家車相同，包括排隊領號、提交資料、等待決定書、最后繳納罰款。需要注意的是，按照規定，一輛車最多可以綁定三個駕駛證，一個駕駛證在一個記分周期內只能處理三輛車的違章問題。