專業店清洗空調系統和自己清洗在費用、清洗范圍、難度專業性及清潔效果等方面存在諸多區別。從費用看，自己清洗成本低，專業店則百元到幾百元不等。清洗范圍上，自己只能處理簡單部分，專業店更全面深入。自己清洗需熟悉構造且易因操作不當損壞部件，專業店人員都經過培訓。清潔效果上，專業店能深度清潔，自己只能去除表面污垢。

在費用層面，自己清洗汽車空調，只需購買一瓶十幾二十塊的空調清潔劑即可，成本相當低。而專業店由于配備專業人員、使用專業設備和清潔劑，價格自然要高一些，掛式空調一般收費 100 - 200 元，立式 200 - 400 元，中央空調更貴 400 - 800 元 。

清洗范圍方面，自己清洗往往只能處理空調濾芯、出風口擋板等相對簡單的部分。對于像蒸發器這種關鍵且清洗麻煩的部件，很難自行處理。專業店的清洗則全面深入得多，不僅能對蒸發器、冷凝器、風葉、風道、水盤等內部部件進行清潔，還能檢查空調的運行狀態以及各部件是否正常，及時發現潛在問題。

清洗難度和專業性上，自己清洗需要對汽車空調的構造有一定了解，操作過程中若稍有不慎，比如用力過猛、使用工具不當，就可能損壞部件。專業店的維修人員都經過專業培訓，熟悉各種車型空調的結構和清洗流程，能夠熟練且安全地完成清洗工作。

清潔效果上，自己清洗大多只是用抹布、刷子加洗潔精，只能清潔表面的過濾網和外機殼，去除一些表面污垢，難以對空調內部深層次的灰塵、細菌等進行有效清理。專業店使用專業清潔劑和設備，能夠深度清潔空調系統，去除內部的霉菌、灰塵等，恢復空調良好的運行狀態，為駕乘人員提供更健康、舒適的環境。

綜上所述，專業店清洗空調系統和自己清洗各有優劣。如果追求便捷、高質量的清洗服務，確保空調得到全面深度清潔，選擇專業店是不錯的選擇；若想節省費用，且對自己的動手能力有信心，嘗試自己清洗也未嘗不可。