整車噴漆有可能會影響車輛的密封性。車身漆面由電泳層、中涂層、色漆層、清漆層構成，原廠車漆在汽車出廠時是最好的，隨便整車噴漆會破壞原廠工藝。而在整車噴漆完工驗收時，若接縫處的漆面過厚或不均勻，就會影響車輛密封性和美觀度。這意味著，若噴漆工藝不到位，就可能對車輛密封性產生不良影響 。

噴漆工藝的好壞對車輛密封性至關重要。在噴漆過程中，專業的技師會嚴格把控各個環節，從對車身的預處理，到噴漆的手法、厚度等，每一步都做到精準無誤。如果在接縫、門窗邊緣等關鍵部位，噴漆師傅沒有掌握好漆層的厚度和均勻度，過厚的漆面可能會導致這些部位無法緊密貼合，從而破壞原本良好的密封結構；不均勻的漆面則可能出現縫隙，外界的灰塵、雨水等就容易通過這些縫隙進入車內，影響車輛的密封性。

此外，后期油漆的質量和耐久性不如原車油漆好，這也可能間接影響到車輛密封性。隨著時間的推移，質量欠佳的漆面可能會出現剝落、開裂等問題，一旦出現這些情況，不僅影響車輛外觀，也會使得密封部位的完整性遭到破壞，進而影響到車輛整體的密封性能。

所以說，整車噴漆是存在影響車輛密封性風險的。不過，若選擇專業正規的噴漆機構，由經驗豐富的技師嚴格按照標準流程操作，將各個環節都處理到位，那么就能在很大程度上降低這種風險，讓車輛在噴漆后依然能保持良好的密封狀態和整體性能。