在4S店更換燃油濾清器和在汽修店更換，在價格、配件來源、服務專業性等方面存在區別。價格上，4S店因運營成本等因素，連同工時費大概500 - 1000元，汽修店成本低，一般100 - 200元。配件上，4S店多為原廠配件，質量適配性佳，汽修店渠道多樣，質量有好有壞。服務專業性上，4S店流程專業、人員經過廠家培訓，汽修店水平參差不齊但有的有個性化服務。

從維修流程的規范性來講，4S 店有著一套標準化的流程。車輛進入 4S 店后，從接待登記，到更換燃油濾清器的每一個步驟，再到最后的檢查交付，都嚴格遵循廠家規定。技術人員在操作時，會使用專業的工具和設備，嚴謹按照標準扭矩擰緊螺絲等，確保安裝到位。而汽修店的流程相對靈活，一些規模較大、管理規范的汽修店，能做到流程嚴謹；但部分小店，可能在操作上隨意性較大，不過，也有汽修店會憑借豐富的經驗，快速且有效地完成更換工作。

在后續的售后保障方面，4S 店通常能提供更完善的服務。如果更換燃油濾清器后短期內出現問題，4S 店會負責免費檢修或重新更換，因為他們使用原廠配件且操作規范，出現問題的概率相對較小。汽修店的售后保障差異較大，一些口碑良好的汽修店，也能提供不錯的售后；但個別小店可能在出現問題后，處理起來較為拖沓，甚至相互推諉責任。

總之，在 4S 店更換燃油濾清器，就像走進一家裝修精致、服務規范的大餐廳，品質和保障讓人放心，但價格稍高；而汽修店則如同街頭巷尾的特色小店，有價格優勢，也可能帶來個性化的驚喜，但在選擇時需仔細甄別，確保能獲得可靠的服務 。