車輛過戶協議書未辦理過戶手續也是有效的。從法律層面來講，只要協議是雙方真實意愿的體現，內容不違反法律法規強制性規定和公序良俗，自雙方達成合意時便成立并生效，在協議雙方之間具有約束作用。不過，物權的轉移以登記為要件，未過戶在面對善意第三人時可能存在問題，還可能引發交通事故責任認定等糾紛。所以，協議雖有效，但仍建議及時辦理過戶。

對于善意第三人而言，車輛的所有權是以登記來判定的。即便簽訂了車輛過戶協議書，倘若沒有辦理過戶登記，那么在法律層面上，車輛的所有權依舊屬于原車主。這就意味著，當出現涉及車輛權益的爭議時，未辦理過戶的受讓方可能無法對抗善意第三人基于登記所主張的權利。

在交通事故責任認定方面，若受讓方使用車輛過程中發生交通事故，且未辦理過戶手續，原車主可能會被牽連其中。盡管有相關法律規定來劃分責任，但原車主為了證明自身與事故并無關聯，往往需要耗費大量的時間和精力。此外，若受讓方存在拖欠車輛相關稅費等情況，原車主同樣可能受到影響。

再者，受讓方后續若想再次轉讓車輛，手續也會變得更為復雜。由于車輛登記信息未變更，會給后續交易帶來諸多不便和潛在風險。

綜上所述，車輛過戶協議書即便在未辦理過戶手續的情況下是有效的，但為了保障雙方的合法權益，確保車輛所有權的明晰，避免后續可能出現的一系列麻煩與糾紛，及時辦理車輛過戶手續是非常必要且明智的選擇。這不僅能讓交易更加安全、規范，也能在最大程度上維護雙方在車輛使用和交易過程中的權益。