自動變速箱維修費用比手動變速箱至少貴兩三千元。手動變速箱結構簡單，主要由齒輪和軸構成，常見維修項目成本不高，維修費用大多在 2000 元以內。而自動變速箱構造精密復雜，由液力變扭器、行星齒輪等組成，關鍵部件維修難度大、成本高，維修費用至少五六千，甚至可達一兩萬。不過，具體差價會因車型、故障情況、配件通用程度等因素而有所不同 。

不同車型的變速箱維修價格差異顯著。像面包車這類車型，手動變速箱維修費用相對較低，大概三百元左右，因為其結構更為基礎簡單。中檔次轎車手動變速箱維修可能上千，不過總體仍在手動擋維修費用常規區間內。而自動變速箱方面，不同擋位類型維修費用也不同，4速自動變速箱維修可能需要2000元，6速自動變速箱可能3000元 。一些特殊故障費用更高，比如液力變矩器故障更換可能需要5000 - 10000元，日產軒逸的CVT變速箱維修費用約6000元到8000元，若更換零部件可能高達2萬元。

故障情況也是影響維修價格差的關鍵因素。手動擋常見故障如漏油、濾油器堵塞等，維修相對輕松，費用也不高。自動變速箱一旦出現故障，往往涉及更多精密部件。例如自動變速箱的閥門更換可能需要幾千到上萬元，再加上變速箱油等其他配件費用，總費用通常較高。而且自動變速箱拆裝和維修復雜耗時，工時費也比手動擋要高很多。

配件通用程度也會左右維修費用的高低。手動變速箱配件通用性更強，市場上容易獲取，價格相對親民。自動變速箱有些配件較為特殊，只能通過特定渠道采購，價格高昂。

總之，自動變速箱維修費用確實高于手動變速箱，差價少則兩三千元，多則上萬元。具體的維修價格，要綜合車型、故障情況以及配件通用程度等多方面因素考量，在維修時車主最好多了解、多比較，做出合適的選擇 。